Genomineプロテオーム受託分析一覧

※ 分析アイテムについての詳細な事項はサービスカタローグをご参照ください。

「サービスカタログダウンロド」

標準納期

質量分析：サンプル到着後4日以内

2-DE分析：サンプル到着後7日から10日以内

＜分析遅延の可能性について＞

下記の理由によって分析遅延になることもありますのでご了承ください。

l 悪天候及び国際状況による航空運送の遅延。

l Genomine社の受注状況による作業日の遅延。（繁忙期）

II．分析依頼の流れ

　分析依頼から、結果入手までの流れは以下の通りです。

1. 会員登録（ジェノマインホームページより）

2. サンプルの準備

3. ホームページから会員ページにログインし、分析依頼に必要事項を記入

4. ジェノマインにサンプルを送付。

5. サンプルの分析

6. e-mailで分析終了の連絡がジェノマインよりお客様に届きます。

7. ホームページから会員ページにログインし、分析結果を入手します

以下、項目ごとの説明を記載いたしますので、ご確認ください。

1．会員登録

会員登録はGenomine社 ホームページから行います。

Genomine社 プロテオーム解析サービスページ（http://genoproteom.com/）に行き、分析依頼をクリックいたしますと、ログイン画面が表示されますので、ここから登録を行います。IDとパスワードを決定していただくほか、お名前、所属機関等必要事項をご入力ください。

＜サービス管理について＞

Genomine社 ホームページの分析サービス管理システムでは、サンプルの到着、解析の進捗、終了までの全過程をメールで逐次お知らせいたします。終了後にはその結果がダウンロード出来るシステムになっております。

2．サンプルの準備

MS 分析用（ 質量分析用 ）サンプルの場合

1. Gel(2-DE gel 又は SDS-PAGE gel)をDW（チリなどの混入が無いようにおねがいいたします）で３回洗浄してください。

2. 分析する spot(又は band)を汚染されてない清潔なカミソリ、メスの刃を用いて切り抜いてください。

※スポット周辺の余分なゲルは出来るだけ除いてください。

3. 切り出したゲル片を1.5mlのエッペンチューブに入れ常温でお送りください。

※チューブにはバッファーや水などは入れずゲル片だけを入れてください。乾燥されたバンドでも構いません。

4. Gel のイメージファイルに切り出した spot(or band)のおよその分子量を記載したものをプリントアウトしていただき、サンプルに同封します。

※分子量はタンパク質同定のためのデータベース検索に必要です。

＜サービスに関する諸注意＞

1. 銀染色で質量分析サンプルを調製する場合は、試薬にグルタルアルデヒドが含まれていない試薬をご利用ください。グルタルアルデヒドが入っている場合はタンパク質がゲルに架橋されるため、分析が行えなくなります。

2. 電気泳動ゲルからのPMF同定の場合、 CBB染色では薄く染まる程度、銀染色では明瞭に染まる程度の量が必要です。

3. 脱色(destaining)は行わなくても結構です。

4. CAF-MALDI sequencing分析と LC-MS/MS MASS分析はＣＢＢ染色されたタンパク質バンドが必要です。１バンドのタンパク質量が少ない場合はバンドが複数必要になります。SPOTの場合は最小限 3-4個のスポットをお送りください。

2-DE 分析用（二次元電気泳動）サンプルの場合ㅡ

1. 4X SDS sample bufferを調製します。

※4X SDS sample buffer(modified) 組成

250mM Tris-HCl(pH6.8)

8% SDS

0.08% Bromophenol Blue

2. 細胞を可溶化します。

　　細胞の可溶化は以下の方法を推奨しております。検体量は解析の可否に大きくかかわりますので、必要量を必ず守っていただきますようにお願いいたします。

「下記のすべての試料は常温で可溶化してから 90℃で5分間加熱後、配送まで常温又は冷蔵保管してください。」

＜動物組織＞

検体量：20mg以上

可溶化法：300ul 4X SDS sample bufferによって破砕し、20分以上可溶化します。

＜植物組織＞

検体量： 10mg 以上

液体窒素による破砕を行った powderを凍結乾燥した試料

＜培養細胞＞

検体量（細胞数）：2 X 10⁶以上

可溶化法：細胞を遠心分離した後、上層液(培地成分)は捨て、ペレットを PBSで2-3回 洗浄し、洗浄液を取り除いたのちに300ul 4X SDS sample bufferで20分以上可溶化します。

＜タンパク質抽出液＞

検体量：1mg程度（Bradford法などで定量して下さい）

可溶化法：4X SDS sample bufferをサンプル量に合わせて加えてください。

※200ugで24cm large gelを用いた2-DEを1回実施できますが、以後の質量分析を考慮して1mg程度の量をお送りください。

3. 処理済みサンプルを1.5mlチューブに入れ、常温でお送りください。

＜サービスに関する諸注意＞

1. 特にご指定のない場合は、pH4-10NLの1次元ゲルと24cmの2次元ゲルを用いて解析を行いますが、その他のpH rangeのゲルも対応可能ですので、ご希望がある場合はご連絡ください。

2. 染色はMALDI-compatible alkaline silver stainingを基本的に行いますので coomassie stainingをご希望の方はサービス依頼の際にお問い合わせください。(genomic sequencingが出来てない種につきましては後で MS分析のために必ずcoomassie stainingを行います)

3. 結果によらず、分析を実施したところまでの費用が発生いたします。

4. 塩濃度の高いサンプルは泳動パターンが乱れる可能性がございますので、サンプル調製の際にはご注意ください。

5. 感染性のあるサンプルは処理の際に確実に不活性化していただくよう、お願い申し上げます。

３．分析依頼

　ホームページの分析依頼もしくは、サービス依頼をクリックし、ログイン画面より分析依頼サイトにログインしていただきます。分析依頼サイトでは分析を希望する解析法、サンプル数、サンプルの詳細情報などをご記入いただきます。情報を送信していただきますと、分析依頼が完了いたします。

４．サンプル送付

　サンプルは常温でジェノマイン社にお送りいただきます。お送りいただく際には、以下のものを入れてください。

l 解析サンプル

l プリントアウトした分析依頼

l 染色したサンプルのゲルイメージおよび分子量が記載されている用紙（切り出したゲルをお送りいただく際に必要です）

＜サンプル送付先＞

Recipient Name: GENOMINE Inc.,

Address: Rm 307, Venture Bldg, Pohang Technopark, Zigok-Dong,

Nam-Gu, Pohang, South Korea,　790-834

＜送付料＞

1. MS分析用サンプル1-3個、2-DE分析用サンプル1個の場合はお客様に送料をご負担いただきます。郵便局の EMSをご利用いただくと、お安く済みます。

2. MS分析用サンプル4個以上、2-DE分析用サンプル2個以上お送りいただく場合は、FedExでGenomine着払いをご指定ください。送料はこちらで負担いたします。着払いをご利用いただく際は、下記のアカウント番号を着払いの欄にご記入ください。

Genomine FedEx Acc. Num.387750908

＜FedExで送付する際の注意事項＞

　FedExで送付いただく際には、上述した書類のほか、以下の書類が必要になります。

l commercial invoice　５部

l タンパク質の送付誓約書　２部

Commercial invoice に関して

commercial invoiceは通関の際にお送りいただくタンパク質サンプルに商業的価値がないことを証明する為に必要な書類です。荷送人 / 輸出者の欄に顧客情報をご記入いただいたお申込者の情報を英語でご記入ください。また、通関を速やかに行うため、 DESCRIPTION OF GOODS欄には non - hazardous protein sample, no commercial valueと明記してください。

タンパク質送付誓約書について

タンパク質送付誓約書は通関の際にお送りいただくタンパク質サンプルに危険性が無い事を証明するために必要な書類です。こちらにも製品名の欄にnon - hazardous protein sampleと明記してください。

サンプルの送付先

GENOMINE Inc., Rm 307, Venture Bldg, Pohang Technopark, Zigok-Dong,Nam-Gu, Pohang, South Korea 790-834

５．サンプル分析

　サンプルの到着から、分析の進捗、分析の完了までの一連の状況はホームページにあるサービス依頼（サービス管理システム）からログインいただくことで、ご覧になれます。

＜分析サービスの方針＞

1. 情報の守秘 : 当社はサンプルを提出された組織(機関、会社)との間に非開示契約がなくても提供されたサンプルの情報についての守秘義務を有します。

2. サンプルの廃棄 : 当社は受託依頼者から依頼されたサンプルについての分析を終了した後、残存するサンプルがある場合には、6ヶ月間またゲルの場合は1年間の保管の後に廃棄することを原則とします。

６．分析完了通知と分析結果の入手

　サンプルの分析が完了しましたら、ジェノマイン社よりお客様にe-mailで通知がございますので、メールに記載されているアドレスからサイトにアクセスしてください。終了したサービスのうち、該当するサービスを選択しますと、そこからデータを入手することができます。

III．解析費用の請求に関して

　解析費用のご請求は、登録情報に基づいてリバネスよりご担当者のもとに請求書をお出しいたします。