Genomineプロテオーム分析サービス
|
I. 分析価格および納期
|
|
• 分析アイテムについての詳細な事項はGenomine社ホームページ(http://genomine.com/jp/)をご参照ください。
• 当ウェブサイトに掲載されている商品の価格には、消費税は含まれておりません。
• 見積もり金額確認をご希望の際は左下の「予想見積り金額」をクリックしてください。
• プロテオーム分析サービス価格表
|
|
|
|
サービス番号
|
サービス名
|
備考
|
価格(￥)
|
納期(日)
(営業日)
|
|
二次元電気泳動
|
|
D3010
|
Silver stained 2-DE gel
plus spot quantification
|
B format
|
46,800
|
7
|
|
D3011
|
Coomassie blue stained 2-DE gel
plus spot quantification
|
B format
|
44,200
|
7
|
D3013
|
Silver stained 2-DE gel
plus expression pattern classification
|
C format
|
58,500
|
7
|
|
D3014
|
Coomassie blue stained 2-DE gel
plus expression pattern classification
|
C format
|
55,900
|
7
|
|
2DE plus Protein
Identification Package
|
|
P1010
|
Package1 2DE plus PMF
|
2DE 1~4 gels
PMF 50 spots
|
728,000
|
3週間以内
|
|
P1020
|
Package1 2DE plus TOF/TOF
|
2DE 1~4 gels
TOF/TOF 30 spots
|
|
P2010
|
Package2 2DE plus PMF
|
2DE 1~4 gels
PMF 100 spots
|
1,378,000
|
3週間以内
|
|
P2020
|
Package2 2DE plus TOF/TOF
|
2DE 1~4 gels
TOF/TOF 60 spots
|
|
P3010
|
Package2 2DE plus PMF
|
2DE 1~4 gels
PMF 150 spots
|
2,028,000
|
3週間以内
|
|
P3020
|
Package2 2DE plus TOF/TOF
|
2DE 1~4 gels
TOF/TOF 90 spots
|
|
タンパク質同定分析
|
|
M4010
|
MALDI-TOF MS (PMF, normal)
|
|
15,600
|
7
|
|
M4018
|
MALDI-TOF MS (PMF, DB matching)
|
|
16,900
|
7
|
|
M4014
|
MALDI TOF MS/MS (TOF/TOF, normal)
|
|
23,400
|
7
|
|
M4019
|
MALDI TOF MS/MS (TOF/TOF, DB matching)
|
|
24,700
|
7
|
|
M4013
|
LC-MS/MS
|
|
66,300~88,400
|
20
|
|
M4015
|
Whole protein mass spec analysis
|
|
18,200
|
7
|
|
M4016
|
MALDI-TOF MS for modification analysis
|
1 enzyme
|
27,300
|
7
|
|
リン酸化タンパク質分析
|
|
P8010
|
Phosphoprotein staining service (SDS-PAGE)
|
|
44,200
|
7
|
|
P8011
|
Phosphoprotein staining service (2-DE Gel)
|
|
53,300
|
7
|
|
P8020
|
Phosphoprotein identification by PMF
|
|
29,900
|
10
|
|
P8030
|
Phosphopeptide identification by PSD
|
|
36,400
|
10
|
|
P8040
|
Phosphorylation site determination by CAF sequencing
|
|
44,200
|
10
|
|
P8050
|
Phosphoprotein enrichment plus Service item1
|
|
70,200
|
10
|
|
P8060
|
Phosphoprotein identification by LC-MS/MS
|
1 enzyme
|
87,100
|
18
|
|
糖タンパク質分析
|
|
G8010
|
Glycoprotein
staining service (12cm strip)
|
|
49,400
|
7
|
|
G8020
|
Deglycosylation
2DE gel analysis
|
|
75,400
|
7
|
|
G8050
|
2DE
gel analysis after Glycoprotein enrichment
|
|
70,200
|
7
|
|
メンブレンブロッティング
|
|
M8010
|
Membrane blotting with 2-D gel(8cm IPG strip)
|
|
58,500
|
7
|
|
M8011
|
Membrane blotting with 2-D gel(12cm IPG strip)
|
|
58,500
|
7
|
|
M8012
|
Membrane blotting with 2-D gel(24cm IPG strip)
|
|
58,500
|
7
|
|
一次元電気泳動
|
|
S1010
|
SDS-PAGE(SILVER STAINED)
|
|
36,400
|
7
|
|
S1020
|
SDS-PAGE(COOMASSIE BLUE STAINED)
|
|
29,000
|
7
|
|
二次元電気泳動ゲルのイメージ分析サービス
|
|
I8010
|
B
format (1~5gels)
|
|
44,200
|
7
|
|
追加1gel当たり
|
|
7,800
|
|
|
I8020
|
C
format (1~5gels)
|
|
87,100
|
7
|
|
追加1gel当たり
|
|
9,100
|
|
|
I8030
|
All spot selection
(Silver, Coomassie/ sample)
|
100
spot 以下
|
15,600
|
7
|
|
101~200
spot
|
29,900
|
|
|
201~300
spot
|
44,200
|
|
|
301~400
spot
|
58,500
|
|
|
401~500
spot
|
72,800
|
|
|
I8040
|
All spot selection (Sypro
ruby, Phosphoprotein,
Glycoprotein/ sample)
|
100
spot 以下
|
29,900
|
7
|
|
101~200
spot
|
58,500
|
|
|
201~300
spot
|
87,100
|
|
|
301~400
spot
|
115,700
|
|
|
401~500
spot
|
145,600
|
|
|
その他
|
|
E1020
|
Spot picking
|
|
2,400
|
|
＜表示価格および予想見積り金額について＞
• 当ウェブサイトに掲載されている商品の価格には、消費税は含まれておりません。
• 価格・仕様等は予告なしに改訂される場合がありますのでご注文の際ご注意ください。
• 本予想見積り金額フォームシステムは顧客で直接入力から調べる概略な見積価として、研究の目的による仕様など（選択オプション）追加の際は追加費用が発生致します。
＜納期＞
• 繁忙期には記載の納期よりお時間を頂く場合がございますので、お急ぎのお客様はご発注前にお問い合わせ下さい。
• 到着したサンプルに対して不明な点がある場合のお問い合わ期間は納期に含まれません。
＜分析遅延の可能性について＞
下記の理由によって分析遅延になることもありますのでご了承ください。
• 悪天候及び国際状況による航空運送の遅延。
• Genomine社の受注状況による作業日の遅延。（繁忙期）
|
II．分析依頼の流れ
|
|
• 分析依頼から、結果入手までの流れは以下の通りです。
1. お問い合わせ
2. 会員登録
3. 見積依頼
4. ご依頼(ご発注）
5. サンプルの準備
6. サンプルのご送付
7. サンプル分析
8. 分析終了・結果物納品
9. 解析費用の請求・回収
• 以下、項目ごとの説明を記載いたしますので、ご確認ください。
|
ご希望の分析内容（項目名、番号, サンプル数、サンプル種など）ご記入頂き下記の窓口まで送付いただければサービス担当者から分析内容を確認しサービス営業日基準一日以内にご連絡します。
-
GENOMINE社ホームページから: http://genomine.com/jp/inquiry/qna.html
- サービス担当者にダイレクトメールを通して: gjkim@genomine.com
会員登録はGENOMINE社サービス管理システム(http://genoproteom.com/o_index_jpn.php)から行います。
IDとパスワードを決定しお名前、所属機関等必要事項をご入力ください。
-
G-SIMS,
サービス管理システムについて
GENOMINE社ホームページの分析サービス管理システムでは、見積りからご依頼、試料の到着、解析の進捗、終了までの全過程をモニタリングすることができますし、サービスの各進行段階ごとの進行状況をメールでご報告致します。終了後にはその結果がダウンロードできるシステムになっております。
Eメール又はお問い合わせフォームを通してGENOMINEサービス担当者との事前相談後にご依頼への連絡を頂き、G-SIMS (サービス分析管理システム)からログインし、サービス申請書から分析の項目名、サンプル数、サンプル種など分析内容の詳細をご記入ください。申請書作成まで完了となると見積サービス段階になり、サービス担当者から最終確定見積書(Quotation)(予定納品物内容を含む)をお客様ページにアップロード致します。
お客様からメールや
G-SIMS(サービス管理システム)など通して最終見積書にご納得をいただけるという連絡を頂ければ依頼済みサービスの段階になります。
MALDI-TOF(/TOF), LC-MS/MS質量分析用サンプル
- Gel(2-DE gel or SDS-PAGE gel)を dust-free D.Wによって2~3回 washing後に、分析予定のspot(or band)をコンタミになら ないように清潔な道具を使⽤して直径0.2cm以内でcuttingします。
*できる限り染⾊されていない部位は除去してください。
- Cuttingした gelを1.5ml micro-tubeに⼊れて常温でお送りください。
*チューブにはバッファーや水などは入れずゲル片だけを入れてください。乾燥させたバンドでも構いません。
- 注意事項
(1) 分子量 20 kDa以下の小さいタンパク質は質量分析に適した長さのトリプシン断片が得られない場合があり、タンパク質を同定できない可能性がございます。Mascot search に使用されるトリプシン断片のサイズは 800～3,500 Da です。
(2) 銀染色で質量分析サンプルを調製する場合は、試薬にグルタルアルデヒドが含まれていない試薬をご利用ください。グルタルアルデヒドが入っている場合はタンパク質がゲルに架橋されるため、分析が行えなくなります。
(3) 電気泳動ゲルからMALDI-TOF同定とMALDI-TOF/TOF 同定の場合、少なくともCBB染色で目視できる程度のタンパク量が必要です。バンドであれば1本、スポットであれば2～3個を目安にご提供ください。銀染色で明瞭に見えている場合でも実際にはタンパク質量不足となる可能性もございますので、できるだけCBB染色での確認をお勧めいたします。
(4) CAF-MALDI sequencing分析とLC-MS/MS分析はCBB染色されたタンパク質バンドが必要です。１バンドのタン
パク質量が少ない場合はバンドが複数必要になります。Spotの場合は最⼩限 3-4個のスポットをお送りください。
(5) 脱色(destaining)は不要です。
(6) 還元処理、アルキル化処理は必要ございません。
Whole Protein Mass Spec Analysis(Intact mass)分析用サンプル
- バッファー は 100 mM Ammonium bicarbonate を推奨いたします。
- 1 mg/mL 以上の濃度のタンパク質溶液（buffer 組成は必ず表記して下さい）を 20μL 以上、1.5 mL のエッペンチューブもしくはネジ式蓋チューブに入れて常温にてご送付下さい。
- タンパク質の分子量は 80 KDa 以下が測定に適しております。それ以上の分子量の場合は、タンパク質の特性によって測定しにくい場合がございます。
- 塩濃度が 50mM 以上の場合は解析に大きな影響を与えるため、バッファー は可能な限り塩濃度無しでご調製ください 。
2-DE(二次元電気泳動)分析用サンプル
(1) 4X SDS sample bufferの調製
￭
4X SDS
sample buffer(modified)組成: 250mM
Tris-HCl(pH6.8), 8% SDS, 0.08% Bromophenol Blue
*β-mercaptoethanol, DTT等の還元剤、ureaは必ず不含の状態でお送りください。
(2) サンプル可溶化
￭ サンプルの可溶化は下記の方法を推奨しております。下記に記載の必要サンプル量は目安ですので、サンプルの種類によってはタンパク質量が不足することもございます。予めご了承ください。
*検体量は分析可否に重要ですので、必要量を必ず守ってください。
また、下記のすべての試料は常温で可溶化してから90℃で5分間加熱処理後、配送まで-20℃以下で保管してください。
|
サンプル
|
必要試料量
|
可溶化法
|
|
動物組織
|
80mg以上
(銀染色の場合は20 mg以上)
|
4XSDSとして調整した SDS sample Bufferを4倍に希釈し、1XSDSとしたものを300µL取って組織に加え、ソニケーターやホモジナイザーを用いて破砕します。さらに 20分以上ローテーター等で撹拌し、90℃で5分間加熱します。
|
|
植物組織
|
0.8g以上
(銀染色の場合は0.2g以上)
|
液体窒素による破砕を行った植物組織粉末
0.8 g を、200
μl 1X SDS sample buffer に入れ、20 分以上ローテーター等で撹拌しながら可溶化します。
|
|
培養細胞
|
細胞数1
X 107以上
(銀染色の場合は2 X 106以上)
|
細胞を遠心分離した後、上層液 (培地成分) は捨て、ペレットを
PBS で
2-3回 洗浄し、洗浄液を取り除いたのちに
300µL 1X SDS sample bufferで 20分以上ローテーター等で撹拌しながら可溶化します。
|
|
唾液
|
1 ml(銀染色)~3 ml(CBB)
|
口を水でよく洗ってから、たまった唾液を3回程度捨て、唾液 1
ml（銀染色）～3
ml をチューブに入れて4XSDS
sample bufferを最終濃度
1Xになるように添加して下さい。
唾液サンプルは、血液試料よりも個人差がとても大きく、同一人物の場合でも時間や日にちによって極めて異なる様相となる場合がございます。そのため、疾患マーカーを探索される場合は、正常コントロール群と患者群はそれぞれ最少4人以上をお勧めします。
|
|
タンパク
質抽出液
|
1 mg(銀染色)~2 mg(CBB)程度
(Bradford法等で定量して下さい。)
|
(動物組織、植物組織、cell
などを
PBS、TBS
など他の
buffer solution によって抽出した場合)
4X
SDS sample bufferを 終濃度が 1X SDS sample buffer になるようにタンパク質抽出液に加え、Vortexで20分間撹拌して調製してください。トータル液量は
2ml、タンパク質濃度は1
mg/ml が理想です。調製後、90℃で5分間加熱します。
*200
μgで
24 cm large gel を用いた二次元電気泳動を 1回実施できますが、以後の質量分析を考慮して 1
mg 程度の量をお送り下さい。
|
|
血清、血漿、尿サンプル
|
尿: 100μl(銀染色)~1ml (CBB)
血清・血漿:
100～150μl(銀染色)~
300μl 程度(CBB)
|
4X SDS sample bufferを 終濃度が
1X SDS sample buffer になるようにサンプルに加え、Vortexで20分間撹拌して調製してください。 調製後、90℃で5分間加熱します。
|
(3) 処理済みサンプルを1.5mlチューブに入れ、常温でお送りください。
￭ 常温露出時間経過による二次元電気泳動のタンパク質安定性テスト結果
- 注意事項
(1) 特にご指定のない場合は、pH4-10NLの1次元ゲルと24cmの2次元ゲルを用いて解析を行いますが、その他のpH rangeのゲルも対応可能ですので、ご希望がある場合はご連絡ください。
(2) 染色はMALDI-compatible alkaline silver stainingを基本的に行いますので coomassie stainingをご希望の方はサービス依頼の際にお問い合わせください。(genomic sequencingが出来てない種につきましては後で MS分析のために必ずcoomassie stainingを行います)
(3) 結果によらず、分析を実施したところまでの費用が発生いたします。
(4) 塩濃度の高いサンプルは泳動パターンが乱れる可能性がございますので、サンプル調製の際にはご注意ください。
(5) 感染性のあるサンプルは処理の際に確実に不活性化していただくよう、お願い申し上げます。
(6) ヒト由来サンプルは提供者のインフォームド・コンセントが得られていることが前提となります。 提供者の個人情報が特定できないようにサンプル名を匿名化して下さい
- サンプルは常温でジェノマイン社までご送付下さい。お送りいただく際には、以下のものを入れてください。
￭ 解析サンプル
￭ プリントアウトした分析依頼
￭ MS分析用(質量分析用)サンプルの場合: 染色したサンプルのゲルイメージおよび分子量が記載されている用紙 (分子量はタンパク質同定のためのデータベース検索の際に参考に致します)
- サンプルは常温でジェノマイン社までご送付下さい。
サンプル送付先：
Genomine, Inc.
BldgB, 1F, 327 Saechonnyeon-dareo, Nam-gu,
Pohang-si, Gyeongsangbuk-do, 37668, Korea
TEL. +82-54-275-2465
FAX. +82-54-275-2460
|
ご送付頂いたサンプルが到着したら進行中のサービス段階になり、分析を開始いたします。
この段階では納期の予定をお知らせするメールが発送されます。
分析サービスの方針
￭
情報の守秘
GENOMINE 社はサンプルを提出された組織 (機関、会社) との間に秘密保持契約がなくても、提供されたサンプルの情報についての守秘義務を有します。 書面での締結が必要な場合はお問い合わせ下さい。
￭
サンプルの廃棄
GENOMINE 社は受託依頼者から依頼されたサンプルについての分析を終了した後、残存するサンプルがある場合には、6 ヶ月間、また Gel の場合は 1 年間の保管の後に廃棄することを原則とします。
サンプルの分析が完了しましたら終了したサービスの段階になり、お客様には分析完了をご報告するメールが発送されます。
G-SIMS(サービス管理システム)からログインし、終了したサービスのうち、該当するサービスを選択しますと、そこからデータを入手（ダウンロード）することができます。
|
III．お支払い
|
|
納品書(Delivery note)と請求書(Invoice)をお送りいたします。送金先は日本国内の株式会社バイオの口座へ送金をお願いします。
|
|
