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タンパク質同定サービス
· MALDI-TOF MSによるペプチドマスフィンガープリント解析の実施
· CAF-MALDI法を利用したペプチドマスフィンガープリント解析の実施
· LC-MS/MSによる質量分析の実施
[ MALDI-TOF MASS SPEC ANALYSIS ]
価格: ￥21,600 (Cat.No.M4010)
解析内容
- ペプチドマスフィンガープリンティング（PMF）によるタンパク質同定
- MALDI-TOF MSによるゲル中、もしくは溶液中タンパク質の解析（ゲルの脱色、タンパク質のゲル内消化、MS分析、データベース検索が含まれます）
サンプル形態
- CBB染色もしくは銀染色によって染色したゲルから切り出したバンド（もしくはスポット）を1.5mlのエッペンチューブに入れてお送りください。
- CBB染色の場合はバンド1本（もしくはスポット1つ）、銀染色の場合はバンド3本以上（もしくはスポット3つ以上）を目安にお考えください。
納品物
- Mascot searchによるタンパク質同定結果2種類（Mascot searchの生データ； htmlファイル）
- MALDI-TOF MSのスペクトルデータ（gifファイル）
- タンパク質同定結果の一覧（エクセルファイル）
- 解析方法、結果の見方を記載した報告書（pdfファイル）
[ MALDI-TOF MASS SPEC ANALYSIS 96well format ]
価格: ￥20,100 (Cat.No.M4011)
解析内容
- ペプチドマスフィンガプリンティング（PMF）によるタンパク質同定
- MALDI-TOFMSによるゲル中、もしくは溶液中タンパク質の解析（ゲルの脱色、タンパク質のゲル内消化、MS分析、データベース検索を含みます）
サンプル形態
- CBB染色もしくは銀染色によって染色したゲルから切り出したバンド（もしくはスポット）を96ウェルプレートに入れてお送りください。
- CBB染色の場合はバンド1本（もしくはスポット1つ）、銀染色の場合はバンド3本以上（もしくはスポット3つ以上）を目安にお考えください。
納品物
- Mascot searchによるタンパク質同定結果2種類（Mascot searchの生データ； htmlファイル）
- MALDI-TOF MSのスペクトルデータ（gifファイル）
- タンパク質同定結果の一覧（エクセルファイル）
- 解析方法、結果の見方を記載した報告書（pdfファイル）
[ CAF-MALDI sequencing ]
価格: ￥38,300 (Cat.No.M4012)
*只今機器点検により当分の間解析サービスは中止となります。
解析内容
- Chemically-assisted fragmentation MALDI-PSD方式のタンパク質断片化とペプチドの検出によるタンパク質同定
※CAFを用いることでペプチドのフラグメント化が促進されます。
- MALDI-TOFMSによるゲル中、もしくは溶液中タンパク質の解析（ゲルの脱色、タンパク質のゲル内消化、MS分析、データベース検索を含みます）
サンプル形態
- CBB染色もしくは銀染色によって染色したゲルから切り出したバンド（もしくはスポット）を1.5mlのエッペンチューブに入れてお送りください。
[ LC-MS/MS MASS SPEC ANALYSIS ]
価格: ￥73,600 (Cat.No.M4013)
解析内容
- LC-MS/MS方式のペプチドの断片化
- LC-MS/MSによるゲル中、もしくは溶液中タンパク質の解析（ゲルの脱色、タンパク質のゲル内消化、MS分析、データベース検索を含みます）
サンプル形態
- CBB染色もしくは銀染色によって染色したゲルから切り出したバンド（もしくはスポット）を1.5mlのエッペンチューブに入れてお送りください。
- CBB染色で確認できる量を推奨しております。
納品物
- Mascot searchによるタンパク質同定結果1種類（Mascot searchの生データ；htmlファイル）
- タンパク質同定結果の一覧（エクセルファイル）
- 解析方法、結果の見方を記載した報告書（pdfファイル）
※生データが必要な場合は分析を依頼される際に、依頼フォームにその旨をご記入ください。
価格: ￥58,000 (Cat.No.M4014)
解析内容
- ペプチドマスフィンガープリンティング（PMF）によるタンパク質同定
- MALDI-TOF/TOF (MS/MS)を利用したMS/MS解析
- MALDI-TOF/TOF (MS/MS)によるゲル中、もしくは溶液中タンパク質の解析（ゲルの脱色、タンパク質のゲル内消化、MS分析、データベース検索が含まれます)
サンプル形態
- CBB染色もしくは銀染色によって染色したゲルから切り出したバンド（もしくはスポット）を1.5mlのエッペンチューブに入れてお送りください。
- CBB染色の場合はバンド1本（もしくはスポット1つ）、銀染色の場合はバンド3本以上（もしくはスポット3つ以上）を目安にお考えください。
納品物
- Mascot searchによるMSの結果に基づいたタンパク質同定結果1種類（Mascot searchの生データ；htmlファイル）
- Mascot searchによるMS/MSの結果に基づいたタンパク質同定結果2種類（Mascot searchの生データ；htmlファイル）
- MALDI-TOF MSのスペクトルデータ（gifファイル）
- タンパク質同定結果の一覧（エクセルファイル）
- 解析方法、結果の見方を記載した報告書（pdfファイル）
[ Whole Protein MASS SPEC Analysis ]
価格: ￥21,600 (Cat.No.M4015)
解析内容
- トリプシン処理を行わずに質量分析を行います。（全長の質量を測定する場合に有効です）
サンプル形態
- 0.7mg/ml 以上の濃度のタンパク質溶液(buffer 組成は必ず表記してください)を 1.5ml のエッペ ンチューブに入れてお送りください。 タンパク質の分子量は 80KDa 以下が測定に適切です。それ 以上の分子量の場合は、タンパク質の特性によって測定しにくい場合がございます。 ご不明な点が ございましたら、ご相談ください。
納品物
- MALDI-TOF を利用する PSD(POST-SOURCE DECAY) モード方式で溶液中のタンパク質全体の分子量を測定した図
- 解析の報告書
[ MALDI-TOF MASS SPEC for Modification Analysis ]
価格: ￥43,200 (Cat.No.M4016)
解析内容
- MALDI-TOFを利用してタンパク質の変形(タンパク質の結合、メチル化など)を分析します。
- MALDI-TOFでゲルや溶液の中のタンパク質の変形について MS分析を行います。(解析の結果を含む)
サンプル形態
- CBB染色もしくは銀染色によって染色したゲルから切り出したバンド(もしくはスポット)を 1.5ml のエッペンチューブに入れてお送りください。
納品物
- 修飾の候補リスト
- MALDI-TOF MSのスペクトルデータ（gifファイル）
- 解析の報告書
MALDI-TOFを利用したタンパク質変形分析
(MALDI-TOF MASS SPEC FOR MODIFICATION ANALYSIS)に適用可能な変形の例
Acetyl (K)
Acetyl (N-term)
Acetyl (Protein N-term)
Amidated (C-term)
Ammonia-loss (N-term C)
Biotin (K)
Biotin (N-term)
Cabamidomethyl ( C )
Carbamyl (K)
Carbamyl (N-term)
Carboxymethyl ( C )
Cation : Na (C-term)
Cation : Na (DE)
Crotonyl (K)
cysTMT6plex ( C )
Deamidated (NQ)
Dehydrated (N-term C)
Dehydro (C)
DiLeu4plex (K)
DiLeu4plex (N-term)
DiLeu4plex (Y)
Dioxidation (K)
Ethanolyl ( C )
ExacTagAmine (K)
ExacTagThiol (C)
Formyl ( N-term)
Formyl (Protein N-term)
Gln->pyro-Glu ( N-term Q)
Gln->pyro-Glu ( N-term E)
Guanidinyl (K)
ICAT-C (C)
ICAT-C:13C(9) ( C )
ICPL (K)
ICPL (Protein N-term)
ICPL:13C(6) (K)
ICPL:13C(6) (Protein N-term)
ICPL:13C(6)2H(4) (K)
ICPL:13C(6)2H(4) (N-term)
ICPL:13C(6)2H(4) (Protein N-term) |
ICPL:2H(4) (K)
ICPL:2H(4) (Protein N-term)
iTRAQ4plex (K)
iTRAQ4plex (N-term)
iTRAQ4plex (Y)
iTRAQ8plex (K)
iTRAQ8plex (N-term)
iTRAQ8plex (Y)
Label:18O(1) (C-term)
Label:18O(2) (C-term)
Met->Hse (C-term M)
Met->Hsl (C-term M)
Methyl (C-term)
Methyl (DE)
Methylthio ( C )
mTRAQ (K)
mTRAQ (N-term)
mTRAQ (Y)
mTRAQ:13C(3)15N(1) (K)
mTRAQ:13C(3)15N(1) (N-term)
mTRAQ:13C(3)15N(1) (Y)
mTRAQ:13C(6)15N(2) (K)
mTRAQ:13C(6)15N(2) (N-term)
mTRAQ:13C(6)15N(2) (Y)
NIPCAM (C)
Oxidation (HW)
Oxidation (M)
Phospho (ST)
phospho (Y)
Propionamide ( C )
Pyridylethyl ( C )
pyro-carbamidomethyl (N-term C)
sulfo (STY)
TMT2plex (K)
TMT2plex (N-term)
TMT6plex (K)
TMT6plex (N-term) |
本分析はMALDI-TOFを利用した
PMF(PEPTIDE MASS FINGERPRINTING)による方式です。
ペプチドに修飾による変形値が追加された際に出られる質量値を予測して出た結果です。
変形の予想されるアミノ酸の正確な位置は提供されませんので、ご了解ください。 |
[ MS分析用試料準備の手順 ]
- Gel(2-DE gel 又は SDS-PAGE gel)をDW（チリなどの混入が無いようにおねがいいたします）で３回洗浄してください。
- 分析する spot(又は band)を汚染されてない清潔なカミソリ、メスの刃を用いて切り抜いてください。
※スポット周辺の余分なゲルは出来るだけ除いてください。
- 切り出したゲル片を1.5mlのエッペンチューブに入れしっかりとフタをしてください。
- ※チューブにはバッファーや水などは入れずゲル片だけを入れてください。乾燥させたバンドでも構いません。
- Gel のイメージファイルと切り出した バンド(もしくはスポット)のおおまかな分子量を記載した資料をプリントアウトしていただき、サンプルに同封してください。
※分子量はタンパク質同定のためのデータベース検索の際に参考にいたします。
＜サービスに関する諸注意＞
- 銀染色で質量分析サンプルを調製する場合は、グルタルアルデヒドが含まれていない試薬をご利用ください。グルタルアルデヒドが入っている場合はタンパク質がゲルに架橋されるため、分析が行えなくなります。
- 電気泳動ゲルからのPMF 同定とMALDI-TOF/TOF 同定の場合、 CBB染色では薄く染まる程度、銀染色では明瞭に染まる程度の量が必要です。CBBの場合はバンド1本以上、銀染色の場合はバンド3本以上を目安にお考えください。
- 脱色(destaining)は行わなくても結構です。
- 還元処理、アルキル化処理は必要ございません。
- CAF-MALDI sequencing分析と LC-MS/MS分析はＣＢＢ染色されたタンパク質バンドが必要です。１バンドのタンパク質量が少ない場合はバンドが複数必要になります。SPOTの場合は少なくとも3-4個のスポットをお送りください。
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