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| [ 2-DE 이미지분석데이터 ] SOM – exel file에 있는 spot 그룹과 그래프와 이미지를 어떻게 보면 되나요?
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C format 분석시에 선정된 후보의 데이터를 사용해 발현변화의 패턴을 나누어 그룹별로 그래프와 대표 이미지를 제공해 드리고 있습니다. 각각 나누어진 그래프에는 유사한 패턴을 보이는 후보가 포함되어 있고, 발현 패턴의 대표 이미지를 편집해 놓았습니다., 동일 그래프에 있는 후보들은 같은 증감의 양상을 보인다고 해석하시면 됩니다. |
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| [ 2-DE 이미지분석데이터 ] 전체 스팟의 데이터를 받고 싶습니다. 가능한가요?
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전체 스팟의 데이터를 정확히 드리기 위해서는 적게는 수백 개 많게는 천여 개가 넘는 모든 스팟을 샘플의 숫자만큼 일일이 수작업으로 detection 하고 데이터를 확인하여야 하는 것이라서, all spot의 data를 제공해 드리는 것은 인력적이나 시간적으로 가능하지 않습니다. 그러나 발현변화가 보이는 후보 선정은 일차적으로 관찰되는 모든 SPOT을 기준으로 육안으로 관찰되고 분석 되어지며, 이후에 intensity를 정확하게 산출하여 비교하게 됩니다. 시간이 많이 걸리더라도 정확한 데이터를 제공해 드리기 위하여 수작업으로 match를 모두 하여 데이터를 제공해 드리니, 선정된 후보 위주로 데이터 열람을 하시면 됩니다. |
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| [ 2-DE 이미지분석데이터 ] 제공되어진 엑셀 파일에 선정된 후보 중 spot intensity 부분에 비어있는 spot이 있습니다. 어떻게 해석하면 되나요?
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A format 분석을 신청하신 경우에는 전체 spot의 intensity data가 제공되지 않으므로, 공란이 있을 수 있습니다. B, C format의 경우에 존재하지 않는 SPOT의 경우 intensity가 1로 표시되어 있으니 참고하시기 바랍니다. |
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| [ 2-DE 이미지분석데이터 ] 반복 실험을 했더니 spot 번호 뒤에 R이라는 표기가 있습니다. 무슨 뜻인가요?
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분석 시기를 다르게 하여 반복 실험을 했을 때 표기가 되며, 기존의 실험에서 존재하였던 SSP번호(spot)라는 의미입니다. R이 없는 번호는 추가 실험 시 새로 관찰되어 부여된 SSP라고 이해하시면 됩니다. |
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| [ 2-DE 이미지분석데이터 ] MW PI 라고 표기된 것은 무엇인가요? 그리고 SSP는 무엇인가요?
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MW(Molecular weight)은 분자량, pI(Isoelectronic point)는 등전점 입니다. SSP(Standard spot)이란 프로그램에서 지정한 spot의 고유 번호로, 추후 같은 샘플을 의뢰하실 때 같은 SSP로 관리가 됩니다. 번호에 특별한 의미가 부여되어 지정된 것은 아니니 참고하시기 바랍니다. |
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